Palmsonntagmorgen

NGSデータを使った解析と、その周辺。

Tips

micromambaを用いたPython環境構築

書籍「エピゲノム情報解析」を出版しました!みんな買ってね! www.coronasha.co.jp 本記事は書籍出版記念更新その1として、micromambaを用いたPython環境構築を紹介します。 (その2もあればいいな) Micromambaとは Linux PC上でのPython環境の構築、仮…

aria2を使ってENAから高速にfastq.gzを取得する

1論文あたりで用いられるデータが年々増加しており、論文の再実験をするためにFASTQをダウンロードするのもなかなか苦労しますよね。 以下の記事でENAからwgetを使ってfastqを取得する方法を紹介していますが、 rnakato.hatenablog.jp 今回はその高速版です…

Linux command Tips

qiita.com

Analysis Tips

解析するうえで参考になる情報まとめ。Tweetはクリックするとスレッドが読めます。 Data Visualization Data analysis R analysis Python analysis 100本ノック Data Visualization Making a heatmap is an essential skill for a bioinformatician. But you…

研究内容を高めて(深めて)いくために大事なこと

随時追加します。Tweetはクリックするとスレッドが読めます。 Here are my 12 guidelines for data exploration and analysis with the right attitude for discovery:1. You never really finish analyzing a dataset. You just decide to stop and move on…

論文・グラント申請書作成のポイントリンク集

随時追加します。Tweetはクリックするとスレッドが読めます。 Academic writing Grant writing 英語論文作成ツール集 ジャーナルに論文を通すまで エピゲノム論文にありがちな間違いについて Conference abstract Recommendation letter Academic writing ア…