Palmsonntagmorgen

NGSデータを使った解析と、その周辺。

2021-01-01から1ヶ月間の記事一覧

sortコマンドの使い方(ファイルのソート)

以下の記事の中で、sortコマンドについて触れていました。 rnakato.hatenablog.jp 多くのコマンドはsorted BEDを要求しますので、事前に以下のコマンドで全てのBEDをソートしておくとストレスがないかと思います。 $ sort -k1,1 -k2,2n in.bed > in.sorted.b…

あけましておめでとうございます

本年も私とこのブログをよろしくお願いします。 と言いつつ、これからこのブログをどうしようかなあ、などと考えています。。 このブログを始めた当初はNGS解析のノウハウを記した日本語のWebサイトはRNA-seq関連くらいしかなく、ChIP-seqはMACSの使い方くら…