Palmsonntagmorgen

NGSデータを使った解析と、その周辺。

2020-01-01から1年間の記事一覧

DROMPAplusを公開しました

少し前になりますが、DROMPA3のアップデートであるDROMPAplusを正式にリリースしました。 DROMPAplus: a pipeline tool for ChIP-seq analysis — DROMPAplus 1.4.0 documentation 今回はその記事です。 Reference 4月に以下の論文を公開しました。ChIP-seq解…

Monocle3をRstudioで起動できる dorowu/ubuntu Dockerイメージ

前回の記事↓では、ブラウザからアクセスできるLinux GUI のDockerイメージを紹介しました。 rnakato.hatenablog.jp このイメージを使って、Rstudio内でMonocle3をGUI起動できるイメージを作ったので紹介したいと思います。 イメージのダウンロード・起動 以…

docker-ubuntu-vnc-desktopを使ってDockerイメージ (ssp_drompa) をGUIで動かす

更新間隔があいてしまいすみません。 論文書いたり博論審査したり、色々大変です。 今日はDockerのお話です。 最近以下のようなツイートを見つけました。 確かに、このdocker image面白い。このdocker imageをrunすると、こんな感じでブラウザやVNCからdocke…