Dockerのイメージを大量にビルドなどしていると、気づくとルート(/)の容量がいっぱいになっていることがあります。 $ df -h ファイルシス サイズ 使用 残り 使用% マウント位置 udev 126G 0 126G 0% /dev tmpfs 26G 2.5M 26G 1% /run /dev/sda3 275G 273G 0 …

そういえばDROMPAplusの紹介記事を全然書いていないことに気づきました。 最近はDockerイメージからのDROMPAplusの使い方をたびたび質問いただくので、今日はDockerを使ったDROMPAplusの使い方を紹介します。 なお、旧バージョンのDROMPA3とDROMPAplusの違い…

前回の記事↓では、ブラウザからアクセスできるLinux GUI のDockerイメージを紹介しました。 rnakato.hatenablog.jp このイメージを使って、Rstudio内でMonocle3をGUI起動できるイメージを作ったので紹介したいと思います。 イメージのダウンロード・起動 以…

更新間隔があいてしまいすみません。 論文書いたり博論審査したり、色々大変です。 今日はDockerのお話です。 最近以下のようなツイートを見つけました。 確かに、このdocker image面白い。このdocker imageをrunすると、こんな感じでブラウザやVNCからdocke…

今回も解析環境構築にまつわるお話です。 結論を先に書くと、Docker使うならSingularityオススメ！ Singularityとは 7月に書いた下記エントリでは、Dockerを使うメリットについて簡単に説明しました。 rnakato.hatenablog.jp 一方、Dockerにはいくつか不満な…

Dockerベースで提供されるパッケージの割合が目に見えて増えてきたように感じるので、簡単なまとめ。 Dockerとは Dockerとはマシン上に違うマシンを立ち上げるための仮想化技術です。 WindowsやMac上でLinux環境を立ち上げたり、Linux上に異なる複数のLinux…